常見的出口檢驗檢疫證書格式包括《檢驗證書》《衛(wèi)生證書》《健康證書》《獸醫(yī)（衛(wèi)生）證書》《動物衛(wèi)生證書》《植物檢疫證書》《熏蒸/消毒證書》等，這些證書在貨物清關(guān)、貿(mào)易結(jié)匯等環(huán)節(jié)發(fā)揮著重要作用。
《檢驗證書》適用于出境貨物（含食品）的品質(zhì)、規(guī)格、數(shù)量、重量、包裝等檢驗項目。該證書的名稱可籠統(tǒng)地寫為《檢驗證書》，也可根據(jù)信用證等要求，選擇《品質(zhì)證書》《重量證書》《數(shù)量證書》《鑒定證書》等名稱，但證明的內(nèi)容應(yīng)與證書名稱基本一致。在同時證明多個內(nèi)容時，可合并出證，如《重量/數(shù)量證書》。
《衛(wèi)生證書》適用于經(jīng)檢驗符合衛(wèi)生要求的出境食品以及其他需要實施衛(wèi)生檢驗的貨物。該證書一般對該批貨物及其生產(chǎn)加工、貯運的衛(wèi)生狀況進行衛(wèi)生評價，或者對貨物藥殘、農(nóng)殘等作定量分析等。
《健康證書》適用于食品以及用于食品加工的化工產(chǎn)品、紡織品、輕工產(chǎn)品等與人、畜健康有關(guān)的出境貨物。該證書與《衛(wèi)生證書》一樣，對于需經(jīng)輸入國家/地區(qū)衛(wèi)生注冊的貨物，證書中“加工廠名稱、地址和編號”一定要與其政府機構(gòu)衛(wèi)生注冊并公布的內(nèi)容一致。
《獸醫(yī)（衛(wèi)生）證書》適用于符合輸入國家或地區(qū)與中國有檢疫規(guī)定、雙邊檢疫協(xié)定以及貿(mào)易合同要求的出境動物產(chǎn)品。該證書一般證明該批貨物系來自安全非疫區(qū)的動物，動物屠宰前后經(jīng)官方獸醫(yī)檢驗認(rèn)為健康，適合人類食用。其中，對輸往俄羅斯的肉類及皮革等動物性原料，應(yīng)出具中俄雙語格式證書。
《動物衛(wèi)生證書》適用于符合輸入國家或者地區(qū)與中國有檢疫規(guī)定、雙邊檢疫協(xié)定以及貿(mào)易合同要求的出境動物，出境旅客攜帶的符合檢疫要求的伴侶動物，符合檢疫要求的供港澳動物。該證書須由海關(guān)總署授權(quán)并向國外推薦備案的簽證獸醫(yī)官簽署后方可使用。
《植物檢疫證書》適用于符合輸入國家或地區(qū)以及貿(mào)易合同簽訂的檢疫要求的出境植物、植物產(chǎn)品、含有植物源性原材料產(chǎn)品以及其他檢疫物（植物性包裝鋪墊材料、植物性廢棄物等）。該證書與《動物衛(wèi)生證書》類似，須由簽證植物檢疫官手簽后使用。
《熏蒸/消毒證書》適用于經(jīng)檢疫處理的出入境動植物及其產(chǎn)品、包裝材料、廢舊物品、郵寄物、裝載容器（包括集裝箱）及其他需檢疫處理的物品等。例如，貨物在裝運過程中經(jīng)常使用木托盤、木箱等包裝材料，在其出口到相關(guān)國家/地區(qū)時，往往需要提供該證書，以此證明該批貨物及其木質(zhì)包裝已經(jīng)過藥物熏蒸/消毒處理。